中国生命科学大数据中心建成

hui国际三大数据中心(NCBI、EBI、DDBJ)对全球生物数据长期占据着主导地位,北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center),作为基因组所的重要研究单元,承担相关公共数据库资源体系的研究与建设,面向我国人口健康和社会可持续发展的重大战略需求,围绕国家精准医学和重要战略生物资源的组学数据,建立海量生物组学大数据储存、整合与挖掘分析研究体系,发展组学大数据系统构建、挖掘与分析的新技术、新方法,建设组学大数据汇交、应用与共享平台。

近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为“The BIG Data Center: from deposition to integration to translation”的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。该研究成果的发表是国内首次以数据中心为模式,整体发布我国生命组学数据资源建设情况,标志着生命与健康大数据中心建设取得实质性重要进展,也标志着我国建设综合性基因组数据资源获得国际同行认可。

数据库结构组成
数据库结构组成

生命与健康大数据中心建成面向国家大数据发展战略的多层次生物组学数据资源系统,包括基于高通量测序的原始组学数据归档库(Genome Sequence Archive,GSA),围绕国家重要战略生物资源的基因组组数据库(Genome Warehouse,GWH),基于测序数据的基因表达数据库(Gene Expression Nebulas,GEN),基于中国人群以及国家重要物种群体的基因组变异数据库(Genome Variation Map,GVM),基于全基因组DNA甲基化图谱的表观基因组数据库(Methylation Bank,MethBank)以及基于大众审编(Community Curation)的生命科学维基知识库(Science Wikis),初步形成我国生命与健康数据汇交与共享平台,具备可服务于全球的基因组数据共享网络。

生命与健康大数据中心章张研究员、赵文明高级工程师以及肖景发研究员为本文共同通讯作者。该研究得到中国科学院战略性先导科技专项、中国科学院国际大科学计划、国家863项目、国家973项目、国家自然基金项目、中国科学院百人计划等项目基金的资助。

论文链接:http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2016/11/28/nar.gkw1060.full

(据中国科学院北京基因组研究所)

原创文章,如若转载,请注明出处。

相关文章

  • 科学家揭示Polycomb复合物促进转录的新功能

    3月22日,国际学术期刊《细胞研究》(Cell Research)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所赵允研究组以及中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所魏刚研究组合作的最新研究成果:“A p…

    2016-03-26
  • 中国科学家揭示非人灵长类动物的高精度三维基因组学图谱

    人类大脑起源于漫长的生命进化过程,其最显著的改变是大脑的认知功能,反映在脑容量的显著扩大和脑结构的高度精细化。在人类进化过程中,“哪些遗传改变造就了人类大脑”是学界长期力图解决的科学问题。 所有器官包括…

    2021-01-28
  • 2023年度中国科学十大进展

    2月29日,国家自然科学基金委员会发布2023年度”中国科学十大进展“,分别为:人工智能大模型为精准天气预报带来新突破、揭示人类基因组暗物质驱动衰老的机制、发现大脑“有形”生物钟的存在及其节律调控机制、农作物耐…

    2024-03-01 世烩
  • 中国科学家发展最新单细胞多重组学测序技术

    (据北京大学)2016年2月23日,《细胞研究》(Cell Research)杂志在线发表了北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组、黄岩谊研究组和首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆…

    2016-02-28
  • 遗传学期刊大规模撤销中国论文

    据英国《卫报》报道,学术出版商Wiley旗下的《分子遗传学与基因组医学》(MGGM)期刊撤销了18篇来自中国作者的论文。经期刊主编与出版商协调,此次撤销被认为是因人权争议引发的最大规模学术撤稿事件。 撤稿声明指…

    2024-02-16
  • 蚊媒肠道内生菌群稳态的维持机制

    3月14日,清华大学医学院程功研究组在《自然 微生物学》(Nature Microbiology) 上以长文形式发表题为“蚊子C型凝集素维持肠道内生菌群稳态” (Mosquito C-type lectins maintain gut microbiome homeostasis) 的学术…

    2016-03-21